Конфигурирование httpd.conf для обработки подстановочных доменов с *несколько* сценарии

Если вы хотите, чтобы все эти URL-адреса попадали в одни и те же 3 сценария - как я понимаю на вашей странице, заполненной данными - то вам не нужно ничего из этого.

Просто перепишите вместо этого относительный URI:

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^([^./]+)\.example\.com$
RewriteRule ^(.*\.php)$ $1?domain=%1 [QSA]

Это будет работать для любого URL.

Я подозреваю, что вы делаете вещи ужасно запутанными без всякой причины - разумное сочетание vhosts и перенаправления решит большинство проблемы без необходимости сложной перезаписи.