Можно защитить сквид от скота, вызывающего с чем-то как Fail2Ban. Это - полностью настраиваемая система, которую можно использовать, чтобы автоматически заблокировать любого пользователя после попытки нескольких логинов на одном из сервисов.
Используйте туннель VPN/SSH для соединения со сквидом. С HTTP все не будет зашифровано по умолчанию, поэтому если Вы захотите его безопасный, туннель он по зашифрованному протоколу.
Вы не можете сделать это ретроспективно, если еще не создали рабочий журнал счетчика, но если вы хотите сделать это в будущем, просто создайте журнал счетчика в perfmon.
Как лучше всего определить, какой объем доступной памяти был вчера в 03:00?
Вы не можете этого сделать, если вы уже не регистрировали его. Эта информация записывается только в том случае, если вы ее записываете. Итак, теперь, когда время прошло, вы не можете вернуть эту информацию. Чтобы иметь его в будущем, посмотрите, что предлагали Чоппер или Джон.
Вы также можете подумать о системе мониторинга, которая может записывать такую информацию для всех ваших серверов ... обычно они довольно сложно настроить, но стоит потраченных усилий, потому что вы можете быть уверены, что у вас всегда будет ответ на такой вопрос.
Если это долгосрочное требование, вы можете рассмотреть возможность использования чего-то вроде MRTG для сбора, записи и построения диаграмм данных с вашего сервера (ов) Windows. Таким образом, вы можете легко собирать данные за длительные периоды времени.