ЕСЛИ Вы просто недооцениваете питание VM, но оставляете его, развернулся, им можно затем управлять через vcenter клиент.
Запустите mysqlcheck, см. Здесь - http://scottlinux.com/2012/06/09/use-mysqlcheck-to-optimize-and-repair-mysql-databases/
Также проверьте, нет ли проблем с вашей RAM / дисками. Кроме того, обновите любую версию MySQL до последней версии.
Если вы недавно обновили mysql, у вас могут отсутствовать некоторые столбцы в системных таблицах или что-то просто не обновилось правильно. взгляните на mysql_upgrade . в более ранних версиях mysql вам придется использовать mysql_fix_privilege_tables
. я думаю, он был удален в 5.5.
не забудьте сделать резервную копию своей базы данных, прежде чем делать что-либо в своей базе данных.