Зависит от распределения.
Для Red Hat, производных и другой ОСНОВАННЫЙ НА ОБ/МИН дистрибутив, можно ввести:
rpm -qa
Для Debian и производных, можно ввести:
dpkg -l
Оба покажут список всех установленных пакетов на машине.
Специально для Вас требования я сделал бы соответствующее и grep-i на httpd (Red Hat) или апач (Debian и др.), php и mysql.
Вы не видите IP-адрес веб-браузера из netstat
, потому что соединения поступают из CloudFlare. Вот как работает CloudFlare.
Чтобы увидеть IP-адреса, вам нужно посмотреть журналы nginx.