Если Вы не уверены в MySQL ограничений по току, имеет, проверьте идентификатор текущего процесса для mysqld с методом по Вашему выбору (вершина, PS aux, pgrep, безотносительно). Затем просто введите
sudo cat /proc/mysql_process_id_you_found/limits
Если это не говорит Вам 8192 для открытых файлов, можно всегда бездельничать init сценарий, как кто-то предположил.
сенсоры
являются частью пакета lm-сенсоров.
Вы сможете установить его с помощью простого
yum install lm_sensors
. Затем попробуйте установить nagios еще раз.