Медленная производительность со стандартной аутентификацией IIS
Кажется, что у Вас может быть плохая запись DNS. Это составляло бы проблему, являющуюся спорадическим. Если существует две записи, иногда хороший возвращается, иногда плохой.
Сделайте nslookup или выройте на имени хоста, чтобы видеть, возвращаются ли 2 других дюйм/с.
Если при доступе к службе выполняется много запросов, и каждый запрос должен быть аутентифицирован, это будет ожидаемым поведением, если файл cookie аутентификации не установлен. Если каждый запрос должен выполнять полную аутентификацию, производительность будет заметно снижена.
Если вы не можете установить файл cookie аутентификации и можете использовать проверку подлинности Windows, в IIS есть параметр для проверки подлинности только первого запроса.
При использовании встроенной проверки подлинности Windows вместе с протоколом проверки подлинности Kerberos в IIS 7.0 может наблюдаться снижение производительности
http://support.microsoft.com/kb/954873