Попробуйте это:
iptables -A INPUT -p tcp --destination-port 3306 -j ACCEPT
ls -lZ dirname
или
ls -l
, но посмотрите на 10-е место в строке каталога. Если после трех триплетов rwx стоит "+", значит, с каталогом связан как минимум acl. Chmod будет удалите acl. См. Также getfacl, setfacl и т. Д.