Вы сделали все необходимые как условие шаги прежде, чем развернуть веб-приложение согласно этому списку?
http://incubator.apache.org/wookie/downloading-and-installing-wookie.html#DownloadingandInstallingWookie-RunningWookiewithTomcatandMySQL
Вы можете легко сделать это с помощью rsyslog, подобного этому
$template DynFile,"/var/log/%HOSTNAME%/%programname%.log"
http://www.rsyslog.com/doc/rsyslog_conf_actions.html