:) У меня есть для вас ответ !!! Я был взволнован, когда нашел это неделю назад. У меня была похожая проблема.
http://wiki.idalko.com/display/SONAUT/Sonar+Authenticator+for+JIRA
Этот парень разветвил код и исправил его для работы со встроенной группой Jira. Я развертываю его на тестовых серверах прямо сейчас ... он отлично работает для меня!