Исправьте меня, если я неправ, но если Вы устанавливаете "A" рекорд DNS site1.com и site2.com к Вашему IP, затем можно использовать апачский обработчик и также если IP будет дающим отклик на ping-запрос сам, то site1.com и site2.com будут также дающими отклик на ping-запрос.
This guy believes it's "caused by the timer job cache being in an inconsistent state" and shows how to rebuild the jobs. Another suggestion was ensuring enough disk space.
There's some exotic solutions as well that include re-running psconfig.