MySQL Administrator, часть ole MySQL GUI Tools Bundle, позволит Вам сделать это.
С другой стороны, Вы могли записать простой пакетный файл, который использует mysqldump, и используйте Windows Task Scheduler для автоматизации его. Пакетный файл в качестве примера может быть найден здесь.
Я бы начал с проверки ваших настроек AV в ваших системах. Symantec Endpoint Protection (и многие другие популярные антивирусные решения) имеют функцию сканирования Outlook, которая вызывает подобные проблемы.