Хотя в документации не говорится, что SpdyEnabled нельзя использовать в определении VHost, похоже, что он применяется ко всему серверу.
Все параметры конфигурации mod_spdy начинаются с префикса "Spdy", и большинство из них могут быть используется либо на верхнем уровне, либо в контексте VirtualHost.
http://code.google.com/p/mod-spdy/wiki/ConfigOptions
Да, вы можете включить mod_spdy для каждого VHost через: SpdyEnabled на