Я думаю, что единственный способ повысить скайп состоит в том, чтобы сделать фильтрацию l7, как Вы сказали. Однако шаблон L7 в скайпе принимает меры, потому что скайп действительно трудно определить. На BlackHat Европа, март 2006, была очень хорошей презентацией о Skype, его безопасности и как она запутывает свой трафик.
Единственная вещь я могу думать об этом, это пытается обычно обнаружить интерактивные соединения и повысить их. "Skype оптимизировал" звуки лучше маркетинговым парням, чем "QOS" ;)
Здесь вы можете найти ответ: https://stackoverflow.com/questions/4209999/an-asp-net-setting-has-been-detected-that-does-not-apply-in-integrated-managed-p
А именно: Не забудьте добавить это в свой web.config
<configuration>
<system.webServer>
<validation validateIntegratedModeConfiguration="false"/>
</system.webServer>
</configuration>