Изменение файла OpenLDAP ldif, бросающего ошибку, но успешно, настраивает?

Полномочия на /home может не позволить апачу читать каталог соответственно.

Документ поддерживает веб-сайты, должен быть под /var/www или /srv/www. Это позволяет Вам иметь строгие меры безопасности на дереве корневого каталога.

Укажите полное DocumentRoot для Ваших виртуальных серверов.

Проверьте, что Вы не включили пользовательские каталоги для своих виртуальных серверов. Они будут идти /home дерево.