Ответ был на самом деле в Samba wiki , но я пропустил его, так как он был для Windows 2003, а я использую Windows 2008 R2.
В любом случае, вам необходимо установить атрибуты Active Directory Unix, где вы можете установить атрибуты homeDirectory и Linux / Unix.
После этого просто добавьте эту строку в /etc/samba/smb.conf:
winbind nss info = rfc2307
. Это будет использовать AD. UID / GID, а также homeDirectory :)