Одна опция состоит в том, чтобы использовать unionfs
Unionfs: наращиваемая файловая система объединения
Этот проект создает наращиваемую файловую систему объединения, которая, может казаться, объединяет содержание нескольких каталогов (ответвления) при разделении их физического содержания. Unionfs полезен для объединенного исходного управления деревом, объединенного содержания CD-ROM разделения, объединенных отдельных каталогов пакета программного обеспечения, сеток данных, и т.д. Unionfs позволяет любое соединение только для чтения и ответвлений чтения-записи, а также вставки и удаления ответвлений где угодно в разветвлении на выходе.
Или другая подобная опция aufs.
Я установил прокрутку на что-то как 65 535 строк.
Вы попытались установить это на что-то более... нормальное? Как 5 000 строк. Эксперимент. Корреляция может быть причинной обусловленностью в этом случае.
FWIW, мой терминал гнома составляет 38 МБ VIRT 15 МБ RES (при выполнении htop), все - значение по умолчанию и никакое составление композита.