Вы должны указать .
(точки) в квадратных скобках вроде [.]
, тогда все должно работать.
РЕДАКТИРОВАТЬ:
Это должно работать: RewriteRule ^ / www [.] domain [.] com /(.*)$ / $ 1 [R = 301, L, QSA]
Точки теперь не обрабатываются как специальные символы.