Необходимо добавить протокол маршрутизации для него для маршрутизации между интерфейсами. RIP будет самым легким настроить. Это руководство обрисовывает в общих чертах шаги для взятия для той ОС.
В Squid 3.1 вам нужна директива to_ipv6
после каждой строки tcp_outgoing_address. Если вы обновитесь до 3.2, у вас не возникнет этой проблемы.
Ссылка: http://www.squid-cache.org/Doc/config/tcp_outgoing_address/