После попытки удалить SELinux, не запускается система; выставочная ошибка “не могущего соединиться с системной шиной”
Я не могу сделать лучшего задания, чем http://munin-monitoring.org/wiki/Debugging_Munin_plugins, но один шаг Вы или не сделали или не отправили, выполняет плагины из /etc/munin/plugins и наблюдение, что они говорят. Попробовать
# /etc/munin/plugins/df
и посмотрите то, что Вы возвращаете. Необходимо также знать это, хотя выполнения munin-узла как корень, плагины не обязательно делают так; посмотрите /etc/munin/{plugins.conf,plugin-conf.d/*} для понимания, которое пользователь любой данный плагин может выполнить как.
Удаление SELinux (путем очистки пакета) НЕ является правильным способом борьбы с этим.
Если вы хотите отключить SELinux, отключите его (или установите в «разрешающий» режим).
Я бы предложил переустановить пакет (для этого вам, возможно, придется загрузиться с диска восстановления).