что относительно mail.check_all_imap_folders_for_new
? (отмеченный вопросом, потому что я имею просто, столкнулся с этим и начнет тестировать этот переключатель теперь),
http://kb.mozillazine.org/Checking_for_new_messages_in_other_folders_-_Thunderbird#IMAP
эта целая вещь много-папок IMAP проверки могла все еще быть немного сомнительной, неважно, как Вы делаете это как этот древний https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi? id=221792 все еще сохранен в состоянии НОВОГО.
Скорее всего, вы столкнулись с проблемой кеша браузера. Очистите кеш на зараженном ПК и повторите попытку. Бьюсь об заклад, вы не увидите проблемы.