Помимо предложения DDNS Chris S имеет (такие как http://www.no-ip.com/services/managed_dns/free_dynamic_dns.html), если Вы выполняете свой собственный DNS, можно использовать Динамические Обновления (Bind IE http://www.zytrax.com/books/dns/ch7/xfer.html#update-policy) с TSIG/SIG
Обновления MySQL редко вызывают повреждение данных ( никогда не случалось со мной), но даже это не должно вызывать беспокойства, если у вас есть резервные копии ваших данных и протестировали процедуру резервного копирования.
Вы действительно тестировали резервные копии, не так ли?
Если вы все еще беспокоитесь об этом, попробуйте запустить обновление в тестовой системе с теми же данными и MySQL обновлен с той же версии.
Или еще лучше, настройте резервную пару серверов баз данных и обновите один, переключитесь на него, а затем обновите другой.