Проверьте my.cnf на своем сервере MySQL, особенно связывание адресного параметра. Большую часть времени Вам нужен он, прокомментировал для принятия соединений на всех IP-адресах сервера.
Честно говоря, у вас не должно возникнуть проблем с NTP в виртуальной среде и в современных операционных системах ... Стоит найти первопричину той проблемы.
Если можете, убедитесь, что у вас есть хорошая инфраструктура NTP (я обычно использую внешний источник NTP или указываю все на основной коммутатор или маршрутизатор) и что у вас есть базовые вещи, такие как аппаратные часы хостов ESXi, установленные и закрывающиеся по времени. Иногда vMotion на другой хост со сдвигом аппаратных часов может вызвать проблемы, которые вы наблюдаете на виртуальных машинах.
Что касается подхода с гостевыми инструментами, это немного взломано. Что делать, если у вас есть виртуальные машины, на которых не работают гостевые инструменты (неподдерживаемые ОС или ситуации с устройствами), или ваши гостевые инструменты находятся в неоптимальном состоянии (например, VMware Tools после обновления ядра Linux).
Я думаю, что причина того, что VMware не рекомендует синхронизацию времени с инструментами, заключается в том, что они хотят предотвратить ситуации, когда в виртуальной машине одновременно действуют два метода синхронизации времени.
Присоединенные виртуальные машины Windows к времени синхронизации домена со своими контроллерами домена по умолчанию, а администраторы Linux настраивают свои машины для NTP (независимо от того, являются ли они виртуальными или физическими). Добавление инструментов VMware в качестве второго источника синхронизации может вызвать нежелательные эффекты, такие как постоянные корректировки.
В этой рекомендации VMWare конкретно говорится не использовать vmware-инструменты для синхронизации времени. Почему? Похоже, многие люди есть проблемы с NTP, и vmware-tools обычно ведет себя в предсказуемым способом.
Я не знаю какой-либо веской причины, кроме того факта, что большую часть времени существует сочетание VMware и физических хостов или какой-либо другой гетерогенной среды. Поэтому они рекомендуют что-то вроде NTP, чтобы ВСЕ синхронизировалось, а не только виртуальные машины с хостом (ами). Использование такого стандарта, как NTP, гарантирует, что любой тип среды может иметь стандартную синхронизацию часов между ОС и аппаратными платформами.