Вы собираетесь создать головные боли Exchange, пытающиеся смешать с HTTP-связываниями для сервисов Exchange.
На вашем месте я или переместил бы Apache в не на Exchange Server, или если у Вас нет выбора, кроме как уехать он там затем добавляет другой интерфейс/IP и связывает Apache с тем другим IP, таким образом, каждый из них имеет их собственный IP и может послушать на тех же портах без конфликта.
Я не знаю, как вы могли бы увидеть поведение, которое вы наблюдаете сейчас, без изменений в конфигурации IIS за пределами установки нового сертификата. Я настоятельно рекомендую восстановить резервную копию метабазы IIS, сделанную до внесения каких-либо изменений, поскольку, по-видимому, Active Sync работала нормально «раньше».
Если у вас нет резервной копии метабазы, я бы рекомендовал укусить пуля и восстановление виртуальных каталогов по умолчанию и повторное прохождение процесса установки, очень сознательно. Вы не можете усугубить ситуацию, так как у вас в любом случае отключение электричества.