в дополнение к комментарию Marcin: второе число в cpufreq-информации-c 0 л, разделенных на 1 000, дает Вам макс. МГц
Поскольку в мире нет волшебства, наиболее резонное объяснение того, что у вас есть два разных nginx двоичные файлы в вашей системе: тот, который вы пытаетесь запустить,