правило iptables с адресом назначения не работает

Очевидно, не видя содержание жесткого диска нет никаких безошибочных ответов, но Мастер Очистки диска обычно делает хорошее начало, и должно быть безопасно удалить папки $NTUninstall из папки Windows (если Вы не планируете удалить текущие исправления).

Как далеко это получило бы Вас к нему?

Править: Вы могли, вероятно, изменить свою временную переменную среды пути на диск D также, чтобы видеть, можно ли использовать пространство на этом, а не диске C.

EDIT2: После разговора в чат-комнате стоит использовать windirstat для обнаружения, куда пространство на жестком диске пошло.