(Преобразование комментария в ответ)
У меня возникла проблема с IE10 и моим приложением ASP.Net, которая оказалась быть ошибкой в ASP.Net, за исключением того, что мои симптомы не имели ничего общего с файлами cookie. Это сводило меня с ума, потому что это могло произойти только на одном из серверов. Я наткнулся на эту статью Скотта Хансельмана и применил исправление к серверу. Исправление теперь поставляется как обычное обновление. Это натянуто, но, возможно, вам стоит попробовать запустить обновления на своем сервере.