Согласно Руководство по проектированию AD, при проектировании вашей структуры необходимо учитывать 2 вещи: 1) делегирование административного контроля и 2) групповые политики.
Поскольку групповые политики не применяются к группам, в основном остается одно - делегирование административного контроля. Ваша модель B дает возможность выполнять локальное делегирование административных задач в каждой школе, что, возможно, вы реализуете, так что я бы пошел на это.
I '
Я думаю, что было бы лучше сохранить все группы, которые содержат участников только из одной школы в рамках одного организационного подразделения, и имеют отдельное подразделение в корне для межшкольных групп. Это поможет в управлении вашей AD в долгосрочной перспективе.