Nginx не поддерживают CGI. Можно попробовать SimpleCGI, но я рекомендую Apache установки для Monitorix.
Прежде всего все, вы его переборщили.
Вам не нужны suphp + php-fpm, поскольку они в основном делают то же самое.
Если вам нужна многопользовательская среда с несколькими виртуальными хостами, вы должны использовать следующий стек: