Это не ограничение ext4, а ограничение формата таблицы разделов MS-DOS, который Вы используете.
Необходимо будет переключиться на таблицы разделов GPT. Используйте gparted или разделенный для создания таблицы разделов GPT на диске. Это позволит Вам создавать разделы, больше, чем 2 ТБ.
fdisk не работает с GPT и не позволит Вам иметь> разделы на 2 ТБ.