Ответы от веб-серверов не становятся упакованными в архив, но две вещи действительно происходят
Я думаю, что те два вместе делают о том же, как Вы предполагаете, но все на основе согласования между клиентом и сервером о возможностях и пожеланиями.
Это не совсем прямой ответ на поддержку активности туннеля GRE, однако вам может быть проще использовать опцию MikroTik EoIP для сервера linux, поскольку она была перенесена и позволяет использовать идентификатор туннеля и поддержку активности аналогичным образом (также обрабатывает фрагментацию для ссылок любого размера).