Марионетка и Шеф-повар не являются действительно инструментами развертывания. Вы могли, конечно, соорудить что-то на скорую руку, но они - больше управления конфигурацией. Популярный инструмент в эти дни для того, что Вы делаете, называют "матрицей". Хотя другие как func или capistrano работали бы также.
Обычный подход к поиску места, куда ушло ваше пространство.
du -ms /path/*[111638 sizes.[1289 sizes проверяет использование диска «скрытыми» открытыми файлами с помощью lsof | grep удален | grep / path