Я столкнулся со следующим дистрибутивом Linux, который может сделать то, что Вы ищете:
[В особенности обработка отказа WAN.]
В то время как не прямой ответ Вам, я надеюсь, что это отвечает на намерение если не специфические особенности Вашего вопроса.
http://www.untangle.com/
Вот сценарий VBS, который должен работать на Вас. Вы могли поместить это в цикл по Вашим именам папок.
Set objISAdm = CreateObject("Microsoft.ISAdm")
objISAdm.MachineName="MyServerName"
Set objCatAdm = objISAdm.GetCatalogByName("MyCatalog")
Set objScopeAdm = objCatAdm.GetScopeByPath("c:\FolderToReScan")
objScopeAdm.Rescan("TRUE")
В последней строке средства TRUE делают полное сканирование. Измените его на ЛОЖЬ, чтобы сделать возрастающее сканирование.
Вот хороший источник для Индексации Сервисных образцов сценария.