Apache mod_wl кодирующий проблему для части URI

На основе Ваших комментариев Вы, вероятно, закончили тем, что смешали mod_fastcgi.so от своей заказной установки с lighttpd версией, установленной из репозитория. Так как версии не соответствуют, это отказывает, когда Вы пытаетесь использовать его. Идеально, Вы удалили бы предыдущую попытку lighttpd полностью, но на данный момент, работали бы find / -name mod_fastcgi.so и удалите все, что это находит. Затем переустановите lighttpd-fastcgi пакет для установки файлов, которые действительно должны быть там с правильной версией.