Да, я думаю, что Вы корректны в RAID-контроллере, портящем числа. Если это скажет драйверу, что операция запустилась, как только это требуют, то драйвер не будет знать, что это все еще ожидает дисковых аппаратных средств в RAID-контроллере. Можно ли вытянуть статистику от RAID-контроллера непосредственно?
Похоже, есть проблема с Ubuntu 14.04 и Apache + mpm-itk. Попробуйте использовать
a2dismod mpm_event
apt-get -f install
и посмотрите, как ваша ранее прерванная установка продолжится без ошибок.