Как я могу препятствовать тому, чтобы второй сетевой интерфейс обновил DNS со своим IP-адресом?

Я думаю show processlist; лучший способ состоит в том, чтобы начать отлаживать эту проблему. show processlist шоу, которые потоки выполняют и их состояние.

Вы могли бы использовать Explain управляйте также, особенно в Ваших наиболее распространенных запросах. Это покажет план выполнения относительно запросов, которые Вы хотите. Возможно, некоторые запросы не имеют никаких индексов или не используют их правильно.

С другой стороны, Вы, вероятно, используете механизм устройства хранения данных MyISAM. Если бы Вам не нужны полнотекстовые поиски (или другой MyISAM определенные функции), я рекомендовал бы Вам мигрировать на InnoDB, который обеспечивает находящиеся на строке блокировки вместо того, чтобы блокировать всю таблицу среди других функций, которые, вероятно, улучшат производительность Вашего MySQL. Вот хорошее сравнение между MyISAM и InnoDB.

Возможно, также необходимо настроить некоторые переменные MySQL. Я рекомендовал бы Вам настроиться key_buffer_size, который является размером буфера, используемого для индексных блоков. Настройте это по крайней мере к 30% Вашей RAM, или процесс переиндексации, вероятно, будет слишком медленным.

Наконец, что не менее важно, включите журнал медленного запроса. Это покажет, какие запросы занимают слишком много времени для выполнения.

Надеюсь, это поможет!