Что учетная запись mrtg обычно выполняет как, и это может быть изменено?

Из документации, в разделе RunAsDaemon:

Если вы хотите, чтобы mrtg выполнялся под определенным пользователем и группой (это не так исправлено запускать MRTG от имени root) тогда вы можете использовать --user=user_name и --group=group_name options on the mrtg commandline.

mrtg --user=mrtg_user --group=mrtg_group mrtg.cfg

http://oss.oetiker.ch/mrtg/doc/mrtg-reference.en.html