Считанные диски походят на в основном записанные диски, таким образом, проблема могла бы произойти от плохого средства записи. Коррекция ошибок в рассматриваемом диске могла быть выключена, усилив проблему в этой системе, в то время как другие не показывают ошибок.
Конечно. Ваше правило NLB должно быть конкретным для портирования 80, таким образом, любые запросы на любой веб-сайт по порту 80 должны быть обработаны NLB. Просто удостоверьтесь, что у Вас есть внешний DNS A или запись CNAME для нового сайта, который указывает на общедоступный IP-адрес веб-сервера. В IIS можно затем добавить заголовки хоста на каждом сайте так, чтобы входящие запросы были направлены к корректному веб-сайту.
Править: Вам не нужны несколько кластеров NLB. Каждый сделает, поскольку это обработает весь трафик, собирающийся портировать 80. IIS будет дифференцироваться между веб-сайтами на основе заголовков хоста.