Samba на Debian Lenny намного медленнее, чем Windows 2008

Вы не упоминали если, как эти серверы подключены... LAN / WAN и т.д., которая будет иметь огромное значение в том, где необходимо начать диагностировать. Если это - LAN, начните контролировать интерфейсы коммутатора, эти серверы включены, ищут ошибки (возможно, Ваши настройки дуплекса/скорости являются неправильными), возможно, один из серверов продолжает запрашивать автоматическое согласование, или существует только неисправный кабель где-нибудь в соединении. Вы могли также видеть тайм-ауты из-за простой перегрузки - существует вредоносное программное обеспечение, зараженное ПК на переключателе / Вы работаете 10BaseT.

Если Вы идете через WAN, запустите с инструмента как smokeping, который будет контролировать соединение и говорить Вам, когда, и как долго, Вы теряете возможность соединения. Если Вы видите отбрасывания, это могло бы быть перегрузкой / дрянная возможность соединения / кто-то ступает на кабель в Вашем ISP... могло быть что-либо.

Шанс бонны.