При установке настроек анонимной аутентификации веб-сайта для использования идентификационных данных пула приложений затем, только необходимо предоставить доступ идентификационных данных пула приложений, если у Вас нет раздела сайта, который не использует анонимную аутентификацию, в этом случае необходимо также предоставить аутентифицируемый пользовательский доступ. Я рекомендую ту конфигурацию. Это обновляется для не управления учетной записью идентификационных данных пула приложений плюс анонимная учетная запись.
Если Вы не пишете в диск, просто перечисляете/читаете, все, что необходимо. Если необходимо записать что-нибудь в диск затем, необходимо будет дать разрешения записи также.
Для № 3, если это - всего 1 сервер, можно сделать это из менеджера IIS и полномочий NTFS. Если Вы планируете написать сценарий этого для нескольких серверов, сообщите нам, и мы можем предоставить более подробную информацию.