IP-адреса на одной сетевой карте или на отдельных сетевых картах? Если раздельные, то в свойствах соединения можно указать, чтобы он не регистрировался в DNS. Если это то же самое, то если это Win2008 или выше, то вы можете использовать netsh подобным образом: Netsh Int IPv4 Address
http://blogs.technet.com/b/rmilne/archive/2012/02/08/fine-grained-control-when-registering-multiple-ips.aspx. В противном случае вам пришлось бы отключить автоматическую регистрацию в DNS и вручную создать нужную запись.