Да, можно добавить локальных пользователей к WSS.
Кроме того, я рекомендовал бы пытаться работать с Вашим ISP, хотя видеть, может ли Ваш VM или быть разъединен от их домена или создавать Ваш собственный домен и управляемый для Вас. Иначе это может закончить тем, что было очень трудно справиться и могло потенциально быть уязвимо для нападений от других машин/пользователей, которым доверяют, который Вы не имеете никакого контроля.
Привязка может только быть сделана на уровне сайта. Они не могут быть сделаны на уровне папки или приложении.
У Вас есть две опции:
Создайте 2-й сайт IIS, свяжите его со своим 2-м поддельным доменом и настройте приложение там
Добавьте 2-ю привязку к своему существующему веб-сайту для Вашего 2-го доменного имени. Затем сайт ответит на обоих доменах. Можно затем использовать некоторую серверную сторону (или даже JavaScript) код для перенаправления/отклонения запросов, которые входят на домене, который Вы не хотите.