Я знаю, что Вы сказали, что Dokuwiki и MediaWiki были оба немного тяжелы, но можно упростить процесс установки до нескольких щелчков путем проверки пакетов здесь:
http://bitnami.org/stack/dokuwiki
http://bitnami.org/stack/mediawiki
Это зависит Вас версия MySQL. При выполнении MySQL 5.0 необходимо использовать:
log_slow_queries = 1
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/server-options.html#option_mysqld_log-slow-queries
И только с новой версией (MySQL 5.1), можно использовать это:
slow_query_log = 1
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/server-system-variables.html#sysvar_log_slow_queries