Мне кажется, что если сопровождающий пакета отправил обновленный файл конфигурации, но вы решили сохранить текущую версию, вы не получите никаких важных изменений в обновленном файле. Почему по умолчанию используется текущая версия, вместо того, чтобы использовать новую и применять к ней изменения?
Вы раздражались бы, если бы локальная настройка к Вашей конфигурации вернулась каждые несколько месяцев? Кроме того, что программное обеспечение должно вывести старые конфигурации для внесения изменений? Стабильное программное обеспечение позволяет корректный переход путем представления новых опций и изменения поведений по умолчанию.
Вы май настраивают dpkg, чтобы всегда использовать новые конфигурации. Добавьте к/etc/apt/apt.conf.d/local
DPkg::options { "--force-confdef"; "--force-confnew"; }