Любое время Вы помещаете период перед файлом файл, "скрыто" в Linux. Это объясняет, почему .htaccess не обнаруживается, но a.htaccess действительно обнаруживается.
Можно попробовать эту команду, чтобы видеть, там ли файл:
ls - la
Можно также попытаться просто отредактировать файл как это:
vi. htaccess
Посмотрите, загружается ли это.;-)
Если Вы имеете в виду невероятно долго как за 2 или 3 минуты перед достижением загрузки ОС это нормально.
Если Вы имеете в виду за 10 минут, прежде чем ОС начнет загружаться, существует или аппаратная проблема, или некоторая диагностика была включена и не отключена снова.
Какая информация подходит на экране во время этих 'тестов'? Можно ли сбросить BIOS для очистки его назад к тому, как это должно работать?