Почти 100% использование диска после обновления до debian 10 без какой-либо причины
Недавно мы обновили наши серверы до debian 10. Установка полностью такая же, как и с debian9, за исключением, конечно, некоторых новых программных пакетов.
Мы используем ядро по умолчанию:
$ uname -a
Linux kt105 4.19.0-6-amd64 #1 SMP Debian 4.19.67-2+deb10u2 (2019-11-11) x86_64 GNU/Linux
Мы используем 2 SSD-диска NVME в программном рейде, и после обновления до debian 10 мы обнаружили высокую загрузку диска. Прокрутите, чтобы увидеть последний столбец:
# iostat -x 20 5
Linux 4.19.0-6-amd64 (kt105) 01/29/2020 _x86_64_ (48 CPU)
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
0.07 0.00 0.04 0.00 0.00 99.89
Device r/s w/s rkB/s wkB/s rrqm/s wrqm/s %rrqm %wrqm r_await w_await aqu-sz rareq-sz wareq-sz svctm %util
nvme0n1 0.00 5.97 0.03 805.42 0.00 9.37 0.00 61.07 0.30 1.31 1.00 19.16 134.83 166.12 99.26
nvme1n1 3.14 2.91 736.61 70.75 8.41 0.96 72.83 24.80 0.15 0.84 1.00 234.74 24.34 164.20 99.26
md0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.39 0.00 0.00 0.00
md1 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.29 1.00 0.00 0.00
md2 0.07 2.34 1.89 68.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.00 29.35 0.00 0.00
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 99.95
Device r/s w/s rkB/s wkB/s rrqm/s wrqm/s %rrqm %wrqm r_await w_await aqu-sz rareq-sz wareq-sz svctm %util
nvme0n1 0.00 1.80 0.00 18.95 0.00 0.55 0.00 23.40 0.00 0.03 0.98 0.00 10.53 541.89 97.54
nvme1n1 0.00 1.80 0.00 18.95 0.00 0.55 0.00 23.40 0.00 0.03 0.98 0.00 10.53 541.89 97.54
md0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md2 0.00 1.10 0.00 17.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.64 0.00 0.00
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 99.95
Device r/s w/s rkB/s wkB/s rrqm/s wrqm/s %rrqm %wrqm r_await w_await aqu-sz rareq-sz wareq-sz svctm %util
nvme0n1 0.00 2.85 0.00 11.15 0.00 1.05 0.00 26.92 0.00 0.04 0.98 0.00 3.91 345.61 98.50
nvme1n1 0.00 2.85 0.00 11.15 0.00 1.05 0.00 26.92 0.00 0.04 0.98 0.00 3.91 345.61 98.50
md0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md2 0.00 2.20 0.00 8.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.00 0.00 0.00
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 99.94
Device r/s w/s rkB/s wkB/s rrqm/s wrqm/s %rrqm %wrqm r_await w_await aqu-sz rareq-sz wareq-sz svctm %util
nvme0n1 0.00 2.10 0.00 22.50 0.00 0.55 0.00 20.75 0.00 0.02 0.99 0.00 10.71 473.71 99.48
nvme1n1 0.00 2.10 0.00 22.50 0.00 0.55 0.00 20.75 0.00 0.02 0.99 0.00 10.71 473.71 99.48
md0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
md2 0.00 1.15 0.00 20.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.74 0.00 0.00
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
0.02 0.00 0.02 0.00 0.00 99.95
Некоторые сообщили об этом как об ошибке в ядре:
https://kudzia.eu/b/2019/09/iostat-x-1-reporting-100-utilization- of-near-idle-nvme-drivers /
Я не уверен, так как температура нашего диска тоже высока:
/sbin/nvme smart-log /dev/nvme0
Smart Log for NVME device:nvme0 namespace-id:ffffffff
critical_warning : 0
temperature : 57 C
available_spare : 100%
available_spare_threshold : 10%
percentage_used : 0%
data_units_read : 48,847,719
data_units_written : 5,641,464
host_read_commands : 357,945,226
host_write_commands : 164,837,853
controller_busy_time : 320
power_cycles : 6
power_on_hours : 17,959
unsafe_shutdowns : 2
media_errors : 0
num_err_log_entries : 0
Warning Temperature Time : 0
Critical Composite Temperature Time : 0
Temperature Sensor 1 : 57 C
Thermal Management T1 Trans Count : 0
Thermal Management T2 Trans Count : 0
Thermal Management T1 Total Time : 0
Thermal Management T2 Total Time : 0
На других серверах, настроенных идентично и все еще работающих debian9, у нас почти 0% использования диска и температура 40 градусов по Цельсию.
iotop показывает не так много доступа к диску:
/sbin/iotop --only -ab -n5 -d5
Total DISK READ: 0.00 B/s | Total DISK WRITE: 0.00 B/s
Current DISK READ: 0.00 B/s | Current DISK WRITE: 0.00 B/s
TID PRIO USER DISK READ DISK WRITE SWAPIN IO COMMAND
Total DISK READ: 0.00 B/s | Total DISK WRITE: 11.94 K/s
Current DISK READ: 0.00 B/s | Current DISK WRITE: 9.35 K/s
TID PRIO USER DISK READ DISK WRITE SWAPIN IO COMMAND
23748 be/4 www-data 0.00 B 60.00 K 0.00 % 0.33 % nginx: worker process
637 be/3 root 0.00 B 0.00 B 0.00 % 0.00 % [jbd2/md2-8]
Total DISK READ: 0.00 B/s | Total DISK WRITE: 7.16 K/s
Current DISK READ: 0.00 B/s | Current DISK WRITE: 9.35 K/s
TID PRIO USER DISK READ DISK WRITE SWAPIN IO COMMAND
23748 be/4 www-data 0.00 B 88.00 K 0.00 % 0.16 % nginx: worker process
637 be/3 root 0.00 B 8.00 K 0.00 % 0.00 % [jbd2/md2-8]
Total DISK READ: 0.00 B/s | Total DISK WRITE: 8.75 K/s
Current DISK READ: 0.00 B/s | Current DISK WRITE: 9.35 K/s
TID PRIO USER DISK READ DISK WRITE SWAPIN IO COMMAND
23748 be/4 www-data 0.00 B 132.00 K 0.00 % 0.11 % nginx: worker process
637 be/3 root 0.00 B 8.00 K 0.00 % 0.00 % [jbd2/md2-8]
Total DISK READ: 0.00 B/s | Total DISK WRITE: 26.26 K/s
Current DISK READ: 0.00 B/s | Current DISK WRITE: 9.35 K/s
TID PRIO USER DISK READ DISK WRITE SWAPIN IO COMMAND
23748 be/4 www-data 0.00 B 252.00 K 0.00 % 0.19 % nginx: worker process
637 be/3 root 0.00 B 12.00 K 0.00 % 0.00 % [jbd2/md2-8]
23749 be/4 www-data 0.00 B 8.00 K 0.00 % 0.00 % nginx: worker process
Кстати, ресинхронизация массива md raid была завершена несколько дней назад:
cat /proc/mdstat
Personalities : [raid1] [linear] [multipath] [raid0] [raid6] [raid5] [raid4] [raid10]
md2 : active raid1 nvme1n1p3[0] nvme0n1p3[1]
932839744 blocks super 1.2 [2/2] [UU]
bitmap: 3/7 pages [12KB], 65536KB chunk
md1 : active raid1 nvme1n1p2[0] nvme0n1p2[1]
523264 blocks super 1.2 [2/2] [UU]
md0 : active raid1 nvme1n1p1[0] nvme0n1p1[1]
4194240 blocks super 1.0 [2/2] [UU]
unused devices: <none>
Я, конечно, уже пытался перезагрузить машину .
Похоже, что-то не работает должным образом. Когда мы использовали этот сервер в производстве в качестве балансировщика нагрузки nginx, мы столкнулись с некоторыми сбоями на высоких пиках, которые не могли быть объяснены. У нас были таймауты восходящего потока, ошибки DNS, ошибки сшивания OSCP с letsencrypt.
Все эти проблемы возникают за один и тот же двухминутный интервал и только при высокой загрузке. Проблемы исчезают примерно через 120 секунд. После этого все работает нормально до следующего пика (примерно 2000-8000 запросов / с).
Или вы считаете температуру и использование диска нормальными?
Это ошибка ядра? Я пропустил что-то важное? Как я могу провести дальнейшие исследования реальной проблемы?
Я совершенно уверен, что 100% использование показано для базовые диски NVMe, которые используются для создания md-raid, являются ошибкой ядра - см. соответствующие отчеты. временное обновление до ядра 5.2 привело к исчезновению 100% использования, мы также протестировали md-raid1 на старых / новых ядрах, включая те, которые сообщают о постоянном полном использовании, и не заметили каких-либо существенных различий в пропускной способности или операциях ввода-вывода в секунду / сек.
температура 57 ° C находится в приемлемом диапазоне, по крайней мере, для Intel P4510 4 ТБ, который мы используем - у них порог предупреждения составляет 70 ° C.
полное раскрытие - я автор цитируемого вами сообщения в блоге.
связанные отчеты об ошибках :
https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=927184
https://bugs.centos.org/view.php?id=15723
https: //github.com/sysstat/sysstat/issues/187
https://github.com/munin-monitoring/munin/issues/1119
https://github.com/netdata/netdata/issues/5744#issuecomment-513873791