Существует использование в одном из файлов/библиотек, которые использует веб-сайт. Использование позволяет, чтобы файлы были загружены на сервер и, это походит, помещенный в произвольные местоположения. Начиная с выполнений PHP, поскольку тот же пользовательский апач работает как, все загруженные файлы будут принадлежать тому пользователю. Во-вторых, потому что Корень Документа был chmoded к 777, он позволяет любому пользователю системы писать файлы/папки в тот путь.
Изменение уровня полномочий, chmod 755 как Вы сделал, поможет в разрешении, что, но я рекомендовал бы просмотреть Ваши журналы/код и устранил бы использование или возможное использование.