Несколько вещей:
Где Вы добирались 3.2.19 от, это не нормальная вкусная версия для CentOS-5.
Можно отключить, исключает с - disableexcludes=all, в случае, если одна из машин исключила определенные пакеты.
Dito. для отключения плагинов (как versionlock), который может исключить пакеты (-noplugins, или - disableplugin =).
Я вполне уверен, с которым 3.2.19 repolist дадут Вам метки времени для данных в repos.: конфетка repolist-v... затем, если метки времени не соответствуют, Вы хотите сделать "вкусный чистый истекать-кэш" на более старом (но с недостающим пакетом это маловероятно).
/bin/sh: line 0: cd: /usr/bin/openssl: Not a directory
.. средства точно, что, Вы пытаетесь изменить каталоги на каталог, который не существует./usr/bin/openssl является двоичным файлом. Что точно Вы пытаетесь сделать, скомпилируйте openssl или nginx?