Удостоверьтесь, что сайт идентифицирует как локальную интранет - если не добавляют его. Удостоверьтесь в - на пользовательском уровне для зоны интранет, удостоверьтесь, что автоматический вход в систему только в зоне интранет проверяется. Существуют другие варианты, которые могли бы подходить для Вашей среды, но это должно указать на Вас в правильном направлении