На вашем месте я сначала настроил сервер испытательного стенда для тиражирования удаленной системы, затем пытаюсь преобразовать ее внутренний, где завинчивание не уничтожит систему.
Я не знаю то, что Вы имеете в наличии как опции с точки зрения того, как Ваша удаленная система размещается. Идеально Вы смогли бы загрузить или заставить это загружать что-то как RIP Linux, размещенная памятью ОС так, чтобы Вы могли управлять жестким диском, ничего не выполняя от него. Я думаю что, если у Вас нет способа управлять тем, что загружается, когда, Вы напрашиваетесь на неприятности, управляя системным диском, все еще выполняя систему.
Вы могли попытаться использовать gparted, чтобы уменьшить Ваши разделы вниз и затем создать новый раздел в пробеле, затем установить FreeBSD в ту часть и сделать "двойную загрузку" в другую систему. Это могло бы быть выполнимо.
Независимо от того, что, тем не менее, я все еще попытался бы делать все это внутреннее с испытательным стендом, чтобы гарантировать, что можно получить его работающий прежде, чем играть с рабочим сервером.