Нет, они отличаются. Они используют различные ядра. В настоящее время "настольная" версия использует linux-image-2.6.28-11-generic ядро, тогда как версия "сервера" использует linux-image-2.6.28-11-server ядро.
В частности, они получают доступ к памяти выше 4 ГБ по-другому
Я решил его наконец. Когда время настает для установки коннектора ISAPI, просто используйте тот, который уже является установкой на другом веб-сайте. Коннектор ISAPI это кажется числами, что два сайта используют его и по всей вероятности создают два отдельных потока, которые не конфликтуют друг с другом. Я также полагал, что можно использовать тот же коннектор ISAPI больше чем для двух веб-сайтов.